Le territoire administratif de la Communauté de Communes de l’Estuaire est à l’articulation entre 5 grandes unités paysagères régionales qui sont d’Ouest en Est : l’Estuaire de la Gironde et ses îles, le marais de Braud-et-Saint-Louis enserré par le nord des coteaux du Blayais et le sud des coteaux du bocage viticole de Mirambeau, et pour finir les marges septentrionales de la Double Saintongeaise (les grandes unités dans l’Atlas des paysages de la Gironde sont C11: L’estuaire et ses îles, C10: Le Marais de Braud-et-Saint-Louis, E6: Le Blayais, D5: les premiers coteaux charentais, D4: les marges de la Double Saintongeaise et dans l’atlas des paysages Poitou-Charentes 405: bocage viticole Mirambeau, 404: coteau de la Gironde, 618: Marais de la Gironde, 507: la Double Saintongeaise).